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February 28, 2024
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细胞动力学实验室

单细胞RNA-seq分析套件

构建先进的单细胞RNA-seq分析流水线,采用机器学习进行细胞类型识别和轨迹分析,用于癌症研究。

单细胞基因组学,机器学习,Vue.js
单细胞RNA-seq分析套件

挑战

细胞动力学实验室使用各种不连接的工具手动处理大型单细胞RNA-seq数据集,导致结果不一致和分析周期延长。他们需要一个统一的平台来支持他们的癌症研究倡议。

我们的解决方案

我们的解决方案使用Vue.js构建响应式用户界面,与基于Python的分析引擎集成,使用Scanpy和Seurat。我们使用scikit-learn和TensorFlow实现了机器学习算法,用于高级细胞分类和轨迹分析,所有这些都部署在Docker容器中。

使用的技术

Vue.js
Python
Scanpy
Seurat
scikit-learn
TensorFlow
MongoDB
Docker

结果与影响

实验室实现了400%的处理速度改进,并识别了以前被忽视的新细胞亚群。标准化流水线在不同研究项目中产生了可重现的结果。

客户推荐

scRNA-seq套件改变了我们对肿瘤细胞异质性的理解。自动化机器学习流水线揭示了用手动方法无法实现的洞察。
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