自动化RNA-seq Nextflow流水线

精准医学联盟使用不一致的协议手动处理RNA-seq样本，等待时间很长。他们需要一个完全自动化、可重现的流水线，能够适应波动的工作负载。

我们设计了一个强大的Nextflow流水线，集成质量控制、比对（STAR）、定量（RSEM）和差异表达分析（DESeq2）。流水线针对AWS Batch进行了优化，使用Docker/Singularity容器以实现最大的可重现性和可扩展性。