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March 15, 2024
8 分钟阅读
BioGenomics研究所

批量RNA-seq分析应用

开发一个全面的基于网络的平台,用于批量RNA-seq数据分析,具有先进的统计算法和为基因组学研究人员提供的交互式可视化。

生物信息学,RNA-seq,网络应用
批量RNA-seq分析应用

挑战

BioGenomics研究所需要一个用户友好的平台来分析大型RNA-seq数据集。他们现有的工作流程是分散的,需要大量的手动处理,导致研究流水线效率低下。

我们的解决方案

我们开发了一个完全集成的网络应用,采用React和Next.js前端,由强大的Python FastAPI后端驱动。该平台集成了经过验证的生物信息学工具,如DESeq2和edgeR进行差异表达分析,并提供交互式D3.js可视化进行数据探索。

使用的技术

React
Next.js
Python
FastAPI
DESeq2
edgeR
D3.js
PostgreSQL

结果与影响

该平台将分析时间减少了75%,使研究人员能够在没有广泛编程技能的情况下进行复杂的RNA-seq分析。该研究所报告研究生产力提高了300%,并能够承担更多的合作项目。

客户推荐

Ducologix开发的RNA-seq分析平台彻底革命了我们的研究能力。以前需要几周的工作现在可以在几小时内完成。
B
BioGenomics研究所
研究团队

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