Construcción de un pipeline de análisis single-cell RNA-seq avanzado con aprendizaje automático para identificación de tipos celulares y análisis de trayectorias para investigación del cáncer.
El Laboratorio de Dinámica Celular procesaba manualmente grandes conjuntos de datos single-cell RNA-seq usando varias herramientas desconectadas, resultando en resultados inconsistentes y ciclos de análisis prolongados. Necesitaban una plataforma unificada para su iniciativa de investigación del cáncer.
Nuestra solución utilizó Vue.js para una interfaz de usuario responsiva, integrada con motores de análisis basados en Python usando Scanpy y Seurat. Implementamos algoritmos de aprendizaje automático con scikit-learn y TensorFlow para clasificación celular avanzada y análisis de trayectorias, todo desplegado en contenedores Docker.
“La suite scRNA-seq ha transformado nuestra comprensión de la heterogeneidad celular en tumores. Los pipelines de aprendizaje automático automatizados han revelado insights que habrían sido imposibles con métodos manuales.”
Hablemos sobre cómo podemos ayudarte a lograr resultados similares con soluciones innovadoras adaptadas a tus necesidades.
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