Pipeline Nextflow RNA-seq Automatizado
Implementación de un pipeline de procesamiento RNA-seq completamente automatizado y escalable con Nextflow para análisis genómico de alto rendimiento en entornos cloud.
El Desafío
El Consorcio de Medicina de Precisión procesaba muestras RNA-seq manualmente con protocolos inconsistentes y largos tiempos de espera. Necesitaban un pipeline completamente automatizado y reproducible que pudiera escalar a cargas de trabajo fluctuantes.
Nuestra Solución
Diseñamos un pipeline Nextflow robusto integrando control de calidad, alineación (STAR), cuantificación (RSEM), y análisis de expresión diferencial (DESeq2). El pipeline fue optimizado para AWS Batch con contenedores Docker/Singularity para máxima reproducibilidad y escalabilidad.
Tecnologías Utilizadas
Resultados e Impacto
Testimonio del Cliente
“El pipeline Nextflow ha transformado nuestras operaciones genómicas. Lo que solía requerir semanas de trabajo manual ahora funciona automáticamente con perfecta reproducibilidad.”
Galería del Proyecto
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Hablemos sobre cómo podemos ayudarte a lograr resultados similares con soluciones innovadoras adaptadas a tus necesidades.
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