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March 15, 2024
8 Min. Lesezeit
BioGenomics Research Institut

Bulk RNA-seq Analyse-Anwendung

Entwicklung einer umfassenden webbasierten Plattform für Bulk RNA-seq Datenanalyse mit erweiterten statistischen Algorithmen und interaktiven Visualisierungen für Genomikforscher.

Bioinformatik, RNA-seq, Webanwendung
Bulk RNA-seq Analyse-Anwendung

Die Herausforderung

Das BioGenomics Research Institut benötigte eine benutzerfreundliche Plattform für die Analyse großer RNA-seq-Datensätze. Ihre bestehenden Arbeitsabläufe waren fragmentiert und erforderten umfangreiche manuelle Verarbeitung, was zu Ineffizienzen in ihrer Forschungspipeline führte.

Unsere Lösung

Wir entwickelten eine vollständig integrierte webbasierte Anwendung mit React und Next.js Frontend, angetrieben von einer robusten Python FastAPI Backend. Die Plattform integriert bewährte bioinformatische Tools wie DESeq2 und edgeR für die Differentialexpressionsanalyse und bietet interaktive D3.js-Visualisierungen zur Datenexploration.

Verwendete Technologien

React
Next.js
Python
FastAPI
DESeq2
edgeR
D3.js
PostgreSQL

Ergebnisse & Auswirkungen

Die Plattform reduzierte die Analysezeit um 75% und ermöglichte es Forschern, komplexe RNA-seq-Analysen ohne umfangreiche Programmierkenntnisse durchzuführen. Das Institut meldete eine 300%ige Steigerung der Forschungsproduktivität und konnte mehr Kooperationsprojekte übernehmen.

Kundenbewertung

Die von Ducologix entwickelte RNA-seq-Analyseplattform hat unsere Forschungsfähigkeiten revolutioniert. Was früher Wochen dauerte, können wir jetzt in Stunden erledigen.
BRI
BioGenomics Research Institut
Forschungsteam

Projektgalerie

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